מיכה קובי, לשעבר בכיר בשירות הביטחון הכללי, מתייחס לאחרונה לסוגיית היחידה היהודית בשב"כ. לדבריו,ביהודה ושומרון יש קבוצה קטנה של אנשים שיש לטפל בהם באופן ממוקד. עם זאת, הוא הביע התנגדות להעברת המחלקה היהודית של השב"כ לאחריות המשטרה, בטענה כי השב"כ מבצע את עבודתו ביעילות.
קובי הביע ביקורת כלפי ראש השב"כ הנוכחי וגורמים במחלקה היהודית שהתבטאו בגנות המתיישבים. הוא סבור כי יש "לנקות את האורוות" במהירות, ולהדיח את ראש השב"כ וכן מספר ראשי חטיבות, כדי להשיב את הסדר על כנו. לדבריו, שינויים מעבר לכך עלולים להזיק לפעילותו של השב"כ.