עו”ד כנרת בראשי מותחת ביקורת חריפה על אופן ניהולו של תיק 1000 וטוענת כי היועץ המשפטי לממשלה לשעבר, אביחי מנדלבליט, לא העניק בזמנו אישור לפתיחה בחקירה. לדבריה, לאחר שהתברר לו כי החלטתו הופרה, ציין כי ניתן היה לעתור לבג”ץ ולהשיג על עמדתו במקום לפעול בניגוד להנחיותיו.

בראשי מוסיפה כי התיק נשען כולו על עדותה של הדס קליין, עדות שעברה תפניות שונות ומעוררות תהייה לאורך ההליך, כאשר חלקים ממנה נגבו בחניונים וללא תיעוד מסודר. לטענתה, בפועל לא קיימות ראיות המבססות את האישומים.

עוד היא טוענת כי החקירה נשענת על פירות העץ המורעל ונוהלה בניגוד לכללים ולחוק, וכי הפרקליטות הגישה לבית המשפט תצהיר שקרי מטעם היועמ”ש תוך שיבוש חמור של הליכי חקירה.